真空冷冻干燥机在生物领域中得到广泛应用，这是因为它可以更大程度上防止生物制品、药品在水和热作用下容易发生性变和分解，对生物组织和细胞体损伤比较少，可以减少活菌体及病毒死亡。低温干燥，物质中挥发性成分损失比较小，微生物生长和酶的作用是没办法进行的，可以保持原来的性状。由于干燥在真空下进行，氧气是非常少的，所以易氧化的物质得到保护。干燥可以排除95%~99%以上的水分，使干燥之后的产品能够长期保存而不致发生变质。比如，人的血浆在液体状态只能保存几个月，而冻干之后则可保存5~10年。例如：麻疹弱毒活疫苗在液态的有效期为3个月，冻干后则可以延长1年。
真空冷冻干燥机相比与常规冻干技术而言，其优越性可以很好地凸显出来：
1、许多热敏性的物质不会发生变性或者失活。
2、在低温下干燥的时候，物质中的一些挥发性成分丢失较小。
3、干燥可以清扫95%-99%以上的水分，干燥后产品可以长时间保存而不发生蜕变。
4、在冻干过程中，微生物成长和酶的作用没办法进行，所以可以保持原本的性状。
5、由于在冻干状态下可以进行干燥，因而体积几乎不变，坚持了正本的结构，不会发生浓缩现象。
6、由于物质中水分在预冻之后是以冰晶形状存在的，原本溶于水的无机盐类溶解物质被均匀地分配在物料中。溶于水中的溶解物质就分出，避免了一般干燥方法中因物料内部水分蒸发所携带的无机盐在表面分出而构成表面硬化的现象。
7、干燥后的物质疏松多孔，呈海绵状，加水后溶解迅速彻底，几乎当即恢复原本的性状。
8、由于真空冷冻干燥机的干燥在真空下进行，氧气很少，所以一些易氧化物质得到了保护。
由此看来，真空冷冻干燥机相比与常规冻干技术而言优势明显。
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